Tàu cao tốc 5 sao Phú Quốc Express được các kỹ sư Việt Nam thuộc Công ty TNHH MTV 189 Bộ Quốc Phòng thiết kế. Đảm bảo theo tiêu chuẩn châu Âu và đã được thử mô hình tại Ba Lan. Với trang bị hệ thống máy cao cấp Roll-Royce MTU đời mới nhất. Vỏ tàu được làm bằng hợp kim nhôm của Ý, hệ thống camera giám sát toàn bộ hành trình và đảm bảo an ninh tối đa trên tàu. Đặc biệt, tàu có sức chứa lên đến gần 300 người và có thể chạy với tốc độ tối đa 30 hải lý/giờ, hoạt động trong cả điều kiện thời tiết khắc nghiệt. Đội ngũ vận hành tàu cũng có thể theo dõi dự báo thời tiết để ấn định lịch tàu chạy trước 30 ngày nhờ vào việc tham gia hệ thống dự báo khí tượng thủy văn quốc tế. Điểm mới trong thiết kế của tàu cao tốc hai thân là giúp tàu có tính ổn định cao, mặt boong rộng tạo nên sự thoải mái, giảm thiệu say sóng.
Bên ngoài khoang VIP là boong tàu ngoài trời có sức chứa lên đến 50 người, tại đây hành khách có thể ngắm nhìn trực tiếp khung canh thiên nhiên trong suốt hải trình. Tàu bao gồm các khoang riêng biệt với hệ thống nội thất sang trọng. Cụ thể ở khoang VIP thiết kế ghế da thật có độ nghiêng ngã 130 độ, được trang bị màn hình giải trí riêng biệt có nội dung phong phú theo tiêu chuẩn quốc tế. Tại khoang ghế phổ thông (ECO) không gian rộng, sang trọng với vách ốp da, sàn cách âm chống ồn và đặc biệt có hệ thống âm thanh tai nghe khồn dây.  Thiết kế đạt chuẩn quốc tế. Được đóng mới hoàn toàn từ đơn vị uy tín, hai máy chính nhập khẩu từ Mỹ, công suất và vận tốc vượt trội. Khả năng hoạt động an toàn trong thời tiết khắc nghiệt, thiết kế hai tầng thông thoáng, sức chứa lên đến 300 hành khách, trang bị đầy đủ thiết bị an toàn hàng hải di chuyển từ Rạch Giá-Phú Quốc